Eestikeelne kogudus tekkis Pärnus 16. sajandil, ja kuigi ei ole täpselt teada, millal eestlased said oma vaimuliku, pärineb näiteks aastast 1584 märge, mille kohaselt on Pärnus jutlustatud ka eesti keeles.

Aastal 1741 andis Vene keisrinna Jelizaveta Petrovna käsu eraldada riigikassast 8000 rubla uue luterliku kiriku ehitamiseks Pärnusse. Valitsejannalt päris senine eesti Jaani kogudus endale ja pühakojale uue nime: Eliisabet. 25. juunil 1744 pandi paika kirikuhoone nurgakivi, ehitusmeistriteks olid Riiast pärit Güterbock ja Wülbern.